Gustavo Scarpa chegou ao Palmeiras em 2018, marcando seus dois primeiros gols no dia 11 de março, em jogo vencido por 3×0 contra o Ituano. O começo da passagem dele pelo Verdão foi conturbado, já que havia uma liminar para que pudesse jogar e ela foi derrubada. Foi somente a partir do meio daquele ano que o meia foi liberado definitivamente do Fluminense.
A temporada 2019 foi boa para ele, acabando o ano como artilheiro do time, ao lado de Dudu, sendo que cada um marcou 13 vezes. Seis destes gols foram na Libertadores da América, em que o clube acabou sendo eliminado para o Grêmio. No jogo de ida, o atleta marcou o gol da vitória, mas na volta uma derrota de virada eliminou o Verdão.
Em 2020, Gustavo Scarpa perdeu espaço no time com o técnico Vanderlei Luxemburgo e quase foi negociado. Mas, com a chegada de Abel Ferreira passou a viver seu melhor período no Alviverde, virando um dos protagonistas da equipe. No começo do trabalho do português, era reserva ou jogava de lateral-esquerdo.
Nas temporadas 2021 e 2022 virou protagonista de vez, se tornando o rei das assistências. Completou 200 jogos pelo Verdão em junho de sua última temporada, sendo também eleito o melhor jogador do Brasileirão Série A. Terminou sua passagem pelo Palmeiras com 233 partidas e 44 gols marcados, além de 59 assistências.
Títulos de Gustavo Scarpa pelo Palmeiras
- Campeonato Brasileiro: 2018 e 2022
- Campeonato Paulista: 2020 e 2022
- Copa Libertadores da América: 2020 e 2021
- Copa do Brasil: 2020
- Recopa Sul-Americana: 2022
Prêmio individuais jogando no Verdão
- Seleção da Copa Libertadores da América: 2019 e 2022
- Jogador do Mês de Junho do Campeonato Brasileiro de 2021
- Jogador do Mês de Junho do Campeonato Brasileiro de 2022
- Jogador do Mês de Outubro do Campeonato Brasileiro de 2022
- Seleção do Campeonato Brasileiro: 2022
- Melhor Jogador do Campeonato Brasileiro: 2022
- Bola de Prata de Melhor Meio Campo do Campeonato Brasileiro: 2022
- Bola de Ouro do Campeonato Brasileiro: 2022
- Troféu Mesa Redonda de Melhor Meio Campo do Campeonato Brasileiro: 2022
- Troféu Mesa Redonda de Melhor Jogador do Campeonato Brasileiro: 2022
